同裂酶
同裂酶,國(guó)內(nèi)外比較一致的定義,是來源于不同物種但能識(shí)別相同DNA序列的限制性內(nèi)切酶,切割位點(diǎn)可以相同也可以不同。不過國(guó)內(nèi)和國(guó)外在同裂酶的定 義及其定名上,隨不同的人有許多差異。國(guó)內(nèi)外還有另一種定義,稱同裂酶是來源于不同物種但能識(shí)別相同DNA序列且切割方式相同的酶。經(jīng)網(wǎng)上檢索,這兩種定 義出現(xiàn)的比例均較大,均具有一定的代表性。
經(jīng)檢索國(guó)外和國(guó)內(nèi)資料,同裂酶的英文以isoschizomer的出現(xiàn)占絕大多數(shù),只有極少數(shù)國(guó)內(nèi)資料將其表示為isocaudomer(與國(guó)內(nèi)文 獻(xiàn)出現(xiàn)的同尾酶相混淆),一致表明同裂酶的英文名應(yīng)為isoschizomer。但是,對(duì)于第二種酶即所謂的異功酶,國(guó)外有一個(gè)一致的名稱,叫做 neoschizomer。
關(guān)于同裂酶,國(guó)外的主要限制酶生產(chǎn)公司如MBI Fermentas、NEB New England Biolabs、Roche、Promega、Amersham Biosciences等均有其介紹,且多數(shù)列出了各個(gè)酶的同裂酶。
同裂酶在基因工程的DNA重組中有重要的應(yīng)用,尤其是在載體構(gòu)建方面往往可以取得巧妙的應(yīng)用。代表性、應(yīng)用較多、較為熟悉的同裂酶比如Sma1和Xma1,它們均識(shí)別CCCGGG,但前者切后產(chǎn)生鈍末端,后者切后產(chǎn)生粘性末端。
一般人主要不太熟悉各個(gè)酶的同裂酶到底都是些什么。不過查同裂酶還算方便,前面提到的各個(gè)主要限制酶生產(chǎn)公司的網(wǎng)頁上均有相應(yīng)的清單。
通過對(duì)Highwire、Elsevier ScienceDirect、SpringerLink、Blackwell、 IngentaConnect、Oxford University Press、John Wiley and Sons、 NCBI Pubmed Central、EBSCOhost等專業(yè)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫檢索,有關(guān)同裂酶的研究文獻(xiàn)還不算很少,但絕大多數(shù)是關(guān)于從一個(gè)物種中發(fā)現(xiàn) 某個(gè)酶的同裂酶的報(bào)道,基本上沒有發(fā)現(xiàn)有關(guān)同裂酶的綜述性文獻(xiàn)和規(guī)律性研究文獻(xiàn),文獻(xiàn)中也很難找到全面性的同裂酶的清單或列表。所以要查找實(shí)用性的同裂 酶,是直接查找上述限制酶生產(chǎn)公司的資料。
同尾酶
同尾酶,即能切割產(chǎn)生相同末端的限制性內(nèi)切酶,一般是指能產(chǎn)生相同粘性末端的限制酶。所有鈍末端酶產(chǎn)生的末端均是相同的,但一般不把它作為同尾酶來 研究。故名思義,同尾酶是不同的酶,它們只是切割DNA產(chǎn)生的末端相同,同尾酶之間的識(shí)別序列可以相同也可以不同,但基因工程中識(shí)別序列不同的同尾酶的應(yīng) 用性zui大。
關(guān)于同尾酶的英文名稱很值得大家研究。
在GOOGLE中搜索“同尾酶",可以從一些中文資料中得到其英文名,但至少有4個(gè):isocaudamer、isocaudarner出現(xiàn)較 多,isocaudiner、isocaudomer出現(xiàn)極少,說明應(yīng)以前兩個(gè)之一為主。問題是,國(guó)內(nèi)不同的學(xué)者在課件和論文中對(duì)前兩個(gè)的用法不一致,究 竟用哪一個(gè)不好定,這其中還有后面講到的原因。
采用這4個(gè)詞從GOOGLE上搜索同尾酶不同的英文名詞出現(xiàn)的頻率,前兩者出現(xiàn)的比后兩者多。但是極需注意的是,出現(xiàn)的網(wǎng)頁幾乎是中文網(wǎng)頁或中國(guó)人的英文網(wǎng)頁,也就是說地道的英文網(wǎng)頁上很難出現(xiàn)這4個(gè)關(guān)于同尾酶的名詞!
更值得注意的是,將這4個(gè)同尾酶的英文名詞逐一在主要專業(yè)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(見上樓)的文章名、關(guān)鍵詞和摘要中進(jìn)行檢索,除EBSCO外竟沒有一篇文章出來!EBSCO上的這2篇文章也是中國(guó)人的中文文章,文章是:
1、 [Construction, expression and purification of repeat fragment polymer of oInhibin alpha- subunit N terminal 1-33 fragment] (chi; includes abstract) By Huang YM, Sheng Wu Gong Cheng Xue Bao, 2005 Mar; Vol. 21 (2), pp. 311-4; PMID: 16013496 (是 用isocaudamer在摘要中檢索出來)
2、 [The structural characteristics, alternative splicing and genetic experession analysis of ADP- ribosylation- factor 1 (arf1) in cotton] (chi; includes abstract) By Ren MZ, Yi Chuan Xue Bao, 2004 Aug; Vol. 31 ( pp. 850-7; PMID: 15481542(是 用isocaudarner在摘要中檢索出來)