如何使用離心機(jī)提取植物基因組DNA
植物基因組DNA提取使用什么樣的離心機(jī)做?具體步驟怎么樣?植物組織提取基因組DNA
一、材料
幼嫩葉子。
二、設(shè)備
移液器,冷凍高速離心機(jī),臺(tái)式高速離心機(jī),水浴鍋,陶瓷研缽,50ml離心管(有蓋)及5ml和1.5ml離心管,彎成鉤狀的小玻棒。(這時(shí)選擇設(shè)備的時(shí)候注意選擇那種通用性強(qiáng)的,可以一機(jī)配多種轉(zhuǎn)子的離心機(jī),可以大大的降低設(shè)備采購成本,比如說我廠生產(chǎn)的TG16臺(tái)式高速離心機(jī),就有16種轉(zhuǎn)子可供選擇,有6*50ml(角轉(zhuǎn)子),16*5ml(角轉(zhuǎn)子),12*1.5/2ml角轉(zhuǎn)子,一款機(jī)型都可以配全,省事省錢,方便使用,帶冷凍的話選擇TGL16臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)或者TGL20臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)即可,也是可配16款轉(zhuǎn)子的詳情參看:三、試劑
1、提取緩沖液Ⅰ:100mmol/L Tris·Cl, pH8.0, 20mmol/L EDTA, 500mmol/L NaCl, 1.5% SDS。
2、提取緩沖液Ⅱ:18.6g葡萄糖,6.9g二乙基二硫代碳酸鈉,6.0gPVP,240ul巰基乙醇,加水至300ml。
3、80:4:16/氯仿:戊醇:乙醇
4、 RnaseA母液
5、其它試劑:液氮、異丙醇、TE緩沖液,無水乙醇、70%乙醇、3mol/L NaAc。
四、操作步驟:
1. 在50ml離心管中加入20ml提取緩沖液Ⅰ, 60℃水浴預(yù)熱。
2. 幼苗或葉子5-10g, 剪碎, 在研缽中加液氮磨成粉狀后立即倒入預(yù)熱的離心管中, 劇烈搖動(dòng)混勻, 60℃水浴保溫30-60分鐘(時(shí)間長,DNA產(chǎn)量高), 不時(shí)搖動(dòng)。
3. 加入20ml氯仿/戊醇/乙醇溶液, 顛倒混勻(需帶手套, 防止損傷皮膚),室溫下靜置5-10分鐘, 使水相和有機(jī)相分層(必要時(shí)可重新混勻)。
4. 室溫下5000rpm離心5分鐘。
5. 仔細(xì)移取上清液至另一50ml離心管,加入1倍體積異丙醇,混勻,室溫放置片刻即出現(xiàn)絮狀DNA沉淀。
6. 在1.5ml eppendorf中加入1ml TE。用鉤狀玻璃棒撈出DNA絮團(tuán),在干凈吸水紙上吸干,轉(zhuǎn)入含TE的離心管中,DNA很快溶解于TE。
7. 如DNA不形成絮狀沉淀,則可用5000rpm離心5分鐘, 再將沉淀移入TE管中。這樣收集的沉淀,往往難溶解于TE,可在60℃水浴放置15分鐘以上,以幫助溶解。
8. 將DNA溶液3000rpm離心5分鐘, 上清液倒入干凈的5ml離心管。
9. 加入5μl RNaseA(10μg/μl), 37℃ 10分鐘, 除去RNA(RNA對(duì)DNA的操作、分析一般無影響,可省略該步驟)。
10. 加入1/10體積的3mol/L NaAc及2×體積的冰乙醇,混勻,-20℃放置20分鐘左右,DNA形成絮狀沉淀。
11. 用玻棒撈出DNA沉淀,70%乙醇漂洗,再在干凈吸水紙上吸干。
12. 將DNA重溶解于1ml TE, -20貯存。
13. 取2μl DNA樣品在0.7% Agarose膠上電泳, 檢測DNA的分子大小。同時(shí)取15μl稀釋20倍, 測定OD260/OD280, 檢測DNA含量及質(zhì)量。
[注意] 5g樣品可保證獲得500μg DNA, 足供RFLP、PCR等分析之用。